重組疫苗的優(yōu)點主要是易于貯存運輸、使用方便等，缺點主要是是存在安全性問題。滅活疫苗的優(yōu)點主要是安全、易保存，缺點主要是是免疫時間較短、接種量比較大等，具體如下：

1、重組疫苗的優(yōu)點主要是易于貯存和運輸，使用方便，制備簡單，容易大量生產(chǎn)，成本低；缺點是存在安全性問題，不能完全排除少數(shù)質(zhì)粒DNA插入到染色體上引起突變的可能性，一旦整合到基因組中，就可能使細(xì)胞癌基因激活或抑癌基因失活。此外會有免疫耐受問題，基因疫苗體內(nèi)持續(xù)產(chǎn)生抗原蛋白，可能打破機體本身的免疫平衡，引發(fā)免疫耐受。

2、滅活疫苗的優(yōu)點是比較安全，容易保存。這種疫苗一般不會導(dǎo)致細(xì)菌在體內(nèi)繁殖，也不會出現(xiàn)相應(yīng)的疾病，同時對身體造成的影響并不大，不會導(dǎo)致太多的過敏癥狀；缺點是免疫時間較短、接種量比較大。滅活疫苗一般需要進行多次接種，如果只接種一次有可能起不到保護作用。