臨床上并不存在肛門指檢最深處是什么位置這種說法。肛門指檢一般是指直腸指檢，該檢查方法主要是從肛門進入直腸來觀察有無異常情況，具體的位置就是直腸，通常需要患者前往醫(yī)院，由專業(yè)醫(yī)生進行該項檢查來了解是否存在相關病變。

直腸指檢主要是使用食指，由肛門伸入直腸的檢查方法。通常情況下，檢查者需要戴手套或者指套，使用適量的潤滑油，先輕輕按摩肛門口部位，等待局部括約肌松弛之后，再將探查手指慢慢插入肛門，觸摸到的位置主要為直腸壁。屬于一種簡單、經濟、實用的檢查方法，對早期發(fā)現(xiàn)肛管、直腸病變有重大的意義。

但單純的該項檢查只能初步判斷病情，并不能完全確診，通常還需要患者結合其他相關檢查綜合評估、診斷。