對于阿米巴結(jié)腸炎，糞便檢查是確診的重要依據(jù)。在病人的新鮮糞便中，特別是在血性黏液處仔細尋找阿米巴原蟲，一旦找到了活動的吞噬有紅細胞的溶組織阿米巴滋養(yǎng)體，即可確診。一次未找到，應(yīng)重復(fù)多次檢查并爭取做細菌及阿米巴培養(yǎng)。鏡檢時應(yīng)注意保溫，否則阿米巴滋養(yǎng)體不活動，不易和巨噬細胞區(qū)別。乙狀結(jié)腸鏡檢查對診斷，特別是鑒別診斷很有幫助。急性期可看到其燒瓶樣潰瘍，潰瘍間黏膜正常。慢性期可看到腸黏膜增生肥厚、肉芽腫及息肉等，可在病變處取活體組織送病理檢查，進一步確定其性質(zhì)。

實驗室檢查

糞便檢查是確診的重要依據(jù)。發(fā)現(xiàn)病原體后尚需鑒別非致病性阿米巴原蟲。目前血清學(xué)檢查發(fā)展很快，是診斷阿米巴病的關(guān)鍵性實驗，大約有90%的患者血清，可通過ELISA、間接血凝及間接免疫熒光等檢測不同滴度的抗體。PCR診斷技術(shù)為十分有效、敏感及特異的方法。鏡下檢獲含四核的包囊，應(yīng)鑒定為溶組織內(nèi)阿米巴或迪斯帕內(nèi)阿米巴；糞中檢測含紅細胞的滋養(yǎng)體，應(yīng)高度懷疑為溶組織內(nèi)阿米巴；血清學(xué)檢查高滴度陽性，應(yīng)高度懷疑為溶組織內(nèi)阿米巴感染。阿米巴病僅由溶組織內(nèi)阿米巴引起。

其他輔助檢查

1、結(jié)腸鏡檢查對那些顯微鏡檢查、血清學(xué)及PCR檢查均未獲陽性結(jié)果，而臨床高度懷疑的病例，可行結(jié)腸鏡檢查或纖維腸鏡檢查。約2/3有癥狀病例中，直腸和乙狀結(jié)腸黏膜可見大小不等的散在潰瘍，表面覆有黃色膿液，邊緣略突出，稍充血，潰瘍與潰瘍之間的黏膜正常。從潰瘍面刮取材料作鏡檢，發(fā)現(xiàn)滋養(yǎng)體機會較多。

2、X線鋇劑灌腸檢查病變部有充盈缺損、痙攣及壅塞現(xiàn)象。此種發(fā)現(xiàn)雖無特異性，但有助于阿米巴瘤與腸癌的鑒別。